朱恒鵬自2014年起出任中國社會科學院經濟研究所副所長，兼任中國社會科學院公共政策研究中心主任，同時亦為國家財政部等多部委醫改諮詢專家。

他具有豐富國企改革研究經驗，曾領導團隊進行10年醫療衞生體制改革追蹤研究，調研全國21省市。

作為經濟學教授，他的研究方向包括產業組織理論、衞生經濟學及公共經濟學等，近年主力研究公立醫院改革、醫療服務模式創新、醫療保障制度及藥品流通和定價體制等。

朱恒鵬於1991年獲北京科技大學工學學士學位，1999年獲中國社會科學院頒授經濟學博士學位。